医学界新聞

生命科学×情報数理科学の新学問領域

インタビュー 西田 幸二

2023.07.03 週刊医学界新聞(通常号):第3524号より

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 疾患の原因は遺伝因子と環境因子に大別される。これまでの医学は,それぞれの因子に焦点を当てた要素還元的アプローチに頼ってきた。一方で,遺伝因子と環境因子の複雑な相互作用による多因子性の慢性疾患の死亡者数は,全世界の死亡者数の約7割を占めている。多因子性疾患の治療と予防をめざした「ヒューマン・メタバース疾患研究」は,2022年度に文科省が進める世界トップレベル研究拠点プログラム事業に阪大が採択され本格的に始動した。本紙ではヒューマン・メタバース疾患研究拠点長を務める西田幸二氏に研究プロジェクトのめざす未来,そして拠点長としての想いを聞いた。

――疾患の解明と治療に向けて,ヒューマン・メタバース疾患研究では遺伝因子と環境因子の複雑な相互作用によって生じる多因子性疾患に焦点を当てています。この理由について教えてください。

西田 前提として押さえていただきたいのは,各人で疾患の原因が異なることです。ヒトゲノムの解読やマウス等での動物実験によって疾患の原因とされる遺伝子が調べられています。しかし,原因遺伝子を持っていても,発症する人としない人がいるのです。これは遺伝因子に加え環境因子との複雑な相互作用によって発症するからと考えられています。特に多因子性の慢性疾患ではこの傾向が顕著であり,これまでマウス実験等で行ってきた単一因子のみに着目した要素還元的アプローチだけでは対応できません。

――それでは,多因子性疾患に対してどのようなアプローチを行うのでしょうか。

西田 患者の生体情報のデジタルコピー(バイオデジタルツイン)を仮想空間に作り,多因子が影響するリアルタイムな生体情報を再現することで,患者ごとに最適な治療を提供する超個別的な治療,さらには発症前からの予防的介入の実現をめざしています()。

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 ヒューマン・メタバース疾患研究の概略

――具体的にどのような生体情報からバイオデジタルツインは構築されますか。

西田 血液検査や画像検査等で得るクリニカルデータ(マクロ情報)と,患者本人から生成されたiPS細胞で再現したミニチュア臓器(オルガノイド)経由で得た生体反応(ミクロ情報)に情報数理科学的な処理を加えて構築します。マクロとミクロの生体情報の統合によって,疾患再現度の高いバイオデジタルツインを構築でき,疾患メカニズムの解明や,新しい治療法の開発が可能になります。

――つまり,バイオデジタルツインは臓器単位で構築できるのですね。

西田 その通りです。今後,構築する臓器を増やしながら臓器間ネットワークにも着目して,最終的には体全体で起こっている生命現象を仮想空間内で再現していきたいです。

――先ほど話題に挙がった情報数理科学的処理とはどのような工程か教えてください。

西田 取得したマクロとミクロな生体情報の関係性をモデリングします。そして,人工知能(AI)をバイオデジタルツインに対する情報の入力処理と出力処理に活用します。

――バイオデジタルツインの利用では,医療者や研究者は具体的にどのような形で患者情報を入力し,どのような形で情報が出力されることになりますか。

西田 われわれはChatGPTのようなマルチモーダルなAIモデルといった基盤も活用するためCTやMRIといった画像情報のみならず,電子カルテに書くような言語情報,それから音声情報の入力も可能となります。そして,医療者や研究者が求める情報を自然言語で出力することを想定しています。

 情報の出力において重要なのはAIによるモデリング(思考過程)を可視化することです。データ入力の結果,将来がんになる可能性を示されてもモデリングの根拠がわからなければ医療の場合は納得できないですよね。従来のAIはこの思考過程がブラックボックスになっていましたが,今ではexplainable AI(説明可能なAI)という手法も発達してきました。バイオデジタルツインの構築のみならず利用においても,AI技術の進化は本プロジェクトの成功に重要な鍵となります。

――西田先生はオルガノイド形成,ヒトiPS細胞から作製した角膜上皮細胞移植の成功など,眼科領域をリードされてきました。対象とする臓器を全身に広げ,情報数理科学も融合する本研究の拠点長となった経緯を教えてください。

西田 大阪大学には分野横断的な融合研究を推進する先導的学際研究機構(Institute for Open and Transdisciplinary Research Initiatives:OTRI)があります。OTRIは文科省が進める世界トップレベル研究拠点プログラム(World Premier International Research Center Initiative:WPI)等の大型プロジェクトに採択されて,研究を大きく発展させることを目標としています。私は,OTRIで生命医科学融合フロンティア研究部門長を務めていた経験から,今回のプロジェクトを発想し,申請しました。その結果,幸運なことにWPIに採択されました。

――審査には激しい競争があったのだと思います。何が評価されたと分析していますか。

西田 生命科学...

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大阪大学ヒューマン・メタバース疾患研究拠点・拠点長/同大医学系研究科眼科学・主任教授

1988年阪大医学部を卒業後,同大病院(眼科)にて研修に励む。大阪厚生年金病院,京府医大で勤務し98年に渡米。米サンディエゴのソーク研究所で研究員を務める。2000年に帰国後,阪大医学系研究科眼科学教室の助手に着任。講師,助教授を経て06年東北大主任教授。10年より阪大主任教授。19年より同大医学系研究科・副研究科長。編著に『角膜クリニック 第3版』(医学書院)ほか。

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